对于初学者来说,诸如自旋多重度、闭壳层、限制性模型等量子化学术语的每一个都足以让人望而却步。本教程重点介绍了闭壳层体系、开壳层体系以及自旋多重度、自旋限制模型、自旋非限制模型等相关计算模型的基本概念。并以氧分子基态的计算为例,详细说明了如何利用Gaussian程序进行闭壳层和开壳层体系的 ​

2017-12-15 21:04转发|评论

Ligandscout是一款优秀的药物设计设计软件,当前最新版本为4.2。 本文介绍了该版本的新增特性:http://t.cn/RYeSp2c ​

2017-12-7 23:13转发|评论

本教程描述了如何用Pymol的CGO绘制球与箭头来表示配体-受体相互作用特征。阅读原文: http://t.cn/RY0usy4 ​

2017-12-2 22:06转发|评论

什么是基组、什么是基赝势,这是量子化学计算入门必需知道的概念。本文介绍了基组和赝势的基本概念、基组的表示方法,并举例说明了在Gaussian程序中如何利用gen和genecp关键字为不同的原子指定基组和赝势。阅读原文: http://t.cn/RYCIoKP ​

2017-12-1 21:49转发|评论

如果您之前对波函数、分子轨道一无所知,那么推荐您阅读本文。本文描述了波函数、原子轨道、分子轨道与前线轨道的基本概念,以及如何用Gaussian与GaussView计算、绘制、可视化、观察分子轨道。http://t.cn/RYfO5v8 ​

2017-11-28 00:00转发|评论

LEADFINDER基于分子对接的虚拟筛选教程,包括:结构准备,能量格点计算,虚拟筛选,方法验证等。

肖高铿 :Lead Finder是一款基于结构虚拟筛选、分子对接软件,本文用演示了如何用lead finder虚拟筛选化合物数据库。http://t.cn/RjjipLc

2017-11-18 21:54转发|评论

过渡态、反应路径与能垒计算的教程

肖高铿 :GAUSSIAN教程之过渡态搜索。 本文以1,3-丁二烯的顺反构象异构体转化为例详解了:(1)如何用量化计算软件高斯(Gaussian)的TS、QST2、QST3三种方法来搜索过渡态(Transition state)结构;(2)如何确认过渡态结构;(3)如何构建反应路径以及计算反应能垒等。 http://t.cn/Rj8lQQk

2017-11-18 21:53转发|评论

采用Ligandscout药效团技术发表的科技论文集,包含了基于结构、基于配体的药效团识别,虚拟筛选,蛋白-蛋白相互作用干扰剂发现,靶标识别,靶点选择性解释等等:http://t.cn/RWo7qj0 ​

2017-10-25 22:17转发|评论

基于分子形状与静电场的骨架跃迁案例

肖高铿 :LSD1是潜在的抗癌比如白血病靶标,但是现有的抑制剂选择并不好,除了LSD1外还作用于hERG而有心脏毒性,因此需要开发新的骨架。本文以现有化合物为起始进行骨架跃迁,发现新的化合物保留了活性降低了心脏毒性。 http://t.cn/RWLA2PZ

2017-10-21 21:44转发|评论

简单、易用的配体-蛋白相互作用分析、展示

肖高铿 :配体-受体相互作用2D图的绘制: 本教程演示了如何用ligandscout绘制2D相互作用图,并保存为任意大小的图。http://t.cn/ROmitb3

2017-10-17 00:20转发|评论

Gaussian教程 | 溶剂化自由能的计算 http://t.cn/ROmxOW3 ​

2017-10-17 00:06转发|评论

Gaussian教程 | pKa预测 : http://t.cn/RO82U2v ​

2017-10-17 00:04转发|评论

做蛋白-蛋白相互作用干扰剂/抑制剂的看过来,分享3个PPI抑制剂的虚拟筛选案例: http://t.cn/R0vIuYO ​

2017-9-20 01:55转发|评论

Alexander等人借助自由能计算、能量拆解预测了Hot spot、并用实验确认了其中3个氨基酸残基;以Hot spot为模板,用ROCS对ZINC11进行虚拟筛选,发现了苗头化合物7.18;再通过相似性搜索,发现活性提高的化合物7.44,这是首个RUNX1/ETO四聚体PPI小分子抑制剂。本策略也适于其它PPI抑制剂的发现。阅读原文: ​

2017-9-17 23:43转发|评论

采用ligandscout基于结构的策略生成蛋白蛋白相互作用药效团模型、虚拟筛选发现首个HIV-1整合酶(Integrase,IN)与它的细胞因子LEDGF/75之间的蛋白-蛋白相互作用(protein–protein interactions,PPI)抑制剂。 ​

2017-9-14 22:00转发|评论

邀请您参加9月13日上午广州《基于配体的药物设计》讲座,免费! http://t.cn/RNDQrwI ​

2017-9-5 22:42转发|评论

中国化学会第十届全国化学生物学学术会议将于9月23-26在武汉隆重开幕,我们在会场等待您的光临为您奉上我们的药物设计方案 http://t.cn/RNCr2yC ​

2017-9-2 20:53转发|评论

中国药物化学学术会议是我国药物化学研究领域的最高科学盛会,广州市墨灵格信息科技有限公司是一家提供分子模拟与药物设计解决方案的供应商,我们将参加本次会展,为各位老师、同学介绍、展示我们的产品与技术。http://t.cn/RC5mYhd ​

2017-8-20 00:57转发|评论

中国药物化学学术会议是我国药物化学研究领域的最高科学盛会,广州市墨灵格信息科技有限公司是一家提供分子模拟与药物设计解决方案的供应商,我们将参加本次会展,为各位老师、同学介绍、展示我们的产品与技术。http://t.cn/RC5mYhd ​

2017-8-20 00:56转发|评论

2017年中国药物化学学术会议将于8月27日-30日在北京国家会议中心隆重举行。中国药物化学学术会议是我国药物化学研究领域的最高科学盛会,本次会议主题为“致力全球新药研究与开发——聚焦新分子、新技术、新疗法”。广州市墨灵格信息科技有限公司是一家提供分子模拟与药物设计解决方案的供应商,我们将 ​

2017-8-20 00:55转发|评论